Særligt i bykørsel er risiciene ofte uforudsigelige. Så meget desto vigtigere er det, at der bliver implementeret tiltag til at forhindre en ulykke. Mercedes-Benz har udstyret CapaCity-bybussen med et væld af sikkerhedsfunktioner, der bidrager til at klare kritiske kørselssituationer.
Således er hver CapaCity og CapaCity L som standard udstyret med svingassistenten Sideguard Assist 2, Frontguard Assist, trafikskiltassistenten Traffic Sign Assist og dæktrykkontrolsystemet TPM (Tire Pressure Monitoring). Den valgfri bremsassistent Preventive Brake Assist 2 advarer mod stationære og bevægelige forhindringer - herunder fodgængere og cyklister - og udløser ved behov en delvis opbremsning for at undgå en ulykke. Derudover kan Citaro udstyres med MirrorCam, som giver bedre udsyn bagud og til siderne end konventionelle spejle.