I bytrafikk er det ikke alltid mulig å forutse farer.Desto viktigere er det da å treffe tiltak for å forebygge ulykker. Mercedes-Benz har utstyrt CapaCity bybuss med en rekke sikkerhetsfunksjoner som gjør det lettere å mestre kritiske kjøresituasjoner.
Alle CapaCity og CapaCity L har blindsoneassistenten Sideguard Assist 2, igangkjøringsovervåkingen Frontguard Assist, trafikkskiltassistenten Traffic Sign Assist og dekktrykkovervåkingssystemet TPM (Tire Pressure Monitoring) som standard. Bremseassistenten Preventive Brake Assist 2 som advarer om stasjonære og bevegelige hindringer - inkludert fotgjengere og syklister - og starter delvis bremsing om nødvendig for å unngå en ulykke, kan levers om ønskelig. Citaro kan også utstyres med MirrorCam, som gir bedre sikt bakove og til siden enn konvensjonelle speil.